O princípio da eletrólise baseia-se na transformação do sal presente na água em cloro, garantindo uma desinfeção natural e eficaz.
A água ligeiramente salgada (concentração de 2 a 5 g/L consoante os modelos, 9 a 10 vezes menos que a água do mar) passa pela célula da eletrólise que transforma o sal em cloro natural.
O cloro natural elimina os microorganismos (bactérias, algas) com a mesma eficácia que o cloro químico, sem os inconvenientes associados a este último (irritações, odores, etc.).
O sistema é cíclico: o sal é reutilizado indefinidamente, não há necessidade de adicionar mais durante a estação (exceto quando renova a água).